Faktor-faktor yang menentukan efisiensi sintesis DNA

Dalam sintesis DNA, RNA, dan asam nukleat non-alami, langkah Deproteksi dan Penggandengan memainkan peran penting.

Langkah Deproteksi adalah menghilangkan gugus DMT pada penyangga padat atau gugus hidroksil 5' pada nukleosida sebelumnya dengan asam organik, dan mengekspos gugus hidroksil untuk langkah penggandengan berikutnya.Asam trikloroasetat 3% dalam diklorometana atau toluena sebagian besar digunakan untuk melakukan langkah deproteksi.Konsentrasi asam trikloroasetat dan waktu deproteksi (deblocking time) mendominasi kemurnian produk akhir.Konsentrasi yang rendah dan waktu deblocking yang tidak mencukupi menyebabkan gugus DMT tidak bereaksi, sehingga menurunkan rendemen dan meningkatkan pengotor yang tidak diinginkan.Waktu deblocking yang lama dapat menyebabkan depurin dari rangkaian yang disintesis, membentuk pengotor yang tidak terduga.

Langkah Kopling sensitif terhadap kandungan air pelarut dan kelembaban di udara.Konsentrasi air dalam sintesis sebaiknya kurang dari 40 ppm, sebaiknya kurang dari 25 ppm.Untuk menjaga kondisi sintesis anhidrat, sintesis asam nukleat harus dilakukan di lingkungan dengan kelembapan rendah, jadi kami menyarankan pelanggan kami untuk menggunakanPeralatan Terlarut Amidites, yang dapat melarutkan Fosforamidit bubuk atau berminyak dalam asetonitril anhidrat untuk menghindari kontak dengan udara.

Faktor-faktor yang menentukan efisiensi sintesis DNA5
Faktor-faktor yang menentukan efisiensi sintesis DNA4

Karena kelarutan fosforamidit lebih baik pada situasi non-air, dan perangkap molekul untuk menyerap jejak air dalam reagen dan di tengah, maka perlu disiapkanPerangkap Molekuler.Kami merekomendasikan 2 g subsieve untuk botol reagen 50-250ml, 5g untuk botol reagen 250-500ml, 10g untuk botol reagen 500-1000ml, dan 20g untuk botol reagen 1000-2000ml.

Pelarutan fosforamidit harus dilakukan dalam atmosfer inert, dan penggantian reagen aktivator dan asetonitril harus diselesaikan tepat waktu.Reagen Pembungkus dan Oksidasi harus digunakan sesegera mungkin, reagen yang terbuka memberikan umur simpan yang lebih pendek, dan aktivitas yang lebih sedikit selama sintesis.


Waktu posting: 09 Agustus-2022